車載空調按照控制系統為劃分標準把空調系統分為手動和自動兩種空調系統兩種。
手動空調
手動空調隻能手動對冷/熱風的溫度和風量進行粗略的分級調節，不能設定車內空調的具體溫度。多見於入門級車型中。
自動空調
自動空調可以根據已設定的溫度，自動調節從而保持車內溫度的恒定。一般空調調節按鈕會有AUTO字樣。
自動空調的功能包括車內溫度和濕度自動調節、回風和送風模式自動控制以及運轉方式和換氣量控制等功能。電控單元將根據駕駛員或乘客通過空調顯示控制面板上的按鈕進行的設定，使空調系統自動運行，並根據各種傳感器輸入的信號，對送風溫度和送風速度及時地進行調整，使車內的空氣環境保持最佳狀態。
經濟運行控制功能：當車外溫度與設定的車內溫度較為接近時，電控單元可以縮短制冷壓縮機的工作時間，甚至在不啟動壓縮機的情況下，就能使車內溫度保持設定狀態，達到節能目的。
全面的顯示功能：通過安置在汽車儀表盤上的空調顯示控制面板，可以隨時顯示當時的設置溫度、車內溫度、車外溫度、送風速度、回風和送風口狀態以及空調系統運行方式等信息，使駕駛員能夠及時全面地瞭解空調系統的工作狀態。
故障檢測和安全功能：電控單元通過自診斷系統可以對系統的狀態進行檢測，並對故障情況進行判斷，當系統中出現故障時，使系統傳入相應的故障安全狀態，防止故障進一步擴大。